图书馆或博物馆将自已馆藏的古籍，高清扫描後传到网上，出版方直接拿来影印出版是否违法？

当然是违法的。因为图书馆和博物馆只给了你了解资讯的权力，并没有对你授权。
出版方直接影印出版后，百分百一告一个准，侵犯版权。

另，最好不要干这种事，图书馆和博物馆的版权是极贵的，分分钟叫你赔得破产。